顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD检测的广泛应用前景!

2022-02-07 07:03:36 来源:
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"突变被归入MRD扫描的蓬勃发展现状是完全一致的,努力这些成效将暂时充分利用下一代MRD扫描的精度。"

同一时间列腺癌的MRD扫描是一种精准且特异的运用于数据分析同一时间列腺癌病征血清那时候面源性遗传物质(如ctDNA)相对数量的新方法。在这种情况下下,病征无法肉眼可见的病变,但其实共存常规流行病学影像新方法无法扫描到但再次会随之而来同一时间列腺癌患的相对来说病变。

MRD,不常称为相对来说残余病变(Minimal Residual Disease)。使用“Minimal” (相对来说)这个辞汇,是因为它在历史文献和流行病学专业人士那时候面不够不常用。不过,“Minimal”这个辞汇也许不具备“误导性”,因为低素质的病变在结节病和用药管理者方面也也许不具备不可忽视涵义。“Measurable”(可测量)一辞汇可不够精准地描述残余在病童人体内的癌细胞的共存。NCCN指南同时使用了“Minimal Residual Disease”(相对来说残余病变)和“Measurable Residual Disease”(可测量残余病变)两个术语。

此外,可行性科学研究表明在大分子素质上扫描多种同一时间列腺癌子类的ctDNA同样不具备流行病学好处,历史文献和流行病学专业人士有时也会使用“Molecular Residual Disease”(大分子残余病变)一辞汇。

近年来,国内外在本体那时候面基于ctDNA的MRD审计(ctDNA-MRD)的流行病学图表和迹象越来越多,开启了本体瘤MRD扫描的风潮。本体瘤ctDNA-MRD扫描的新技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(责怪系统性)

对原发民间组织来进行测序以断定病征的特异真核生物变异图说,然后的设计引物自定义panel或使用相同panel来进行个性简化的ctDNA扫描系统性。

2)Tumor-uninformed assays(不责怪系统性)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即必需原发民间组织,数发挥作用各别预先选定引物/探头的设计的与同一时间列腺癌子类特别的相同panel来进行ctDNA扫描系统性,不常在扫描ctDNA性状的同时,;还有ctDNA突变或片段组学等多组学新方法。补足了民间组织比对过剩或数据分析碱基过剩或TAT过长等情况。

Tumor-informed assays的新技术解决方案不够符合大众的认知,在情况下高抗原的同一时间提下,可通过数据分析多碱基的sample-level(比对素质)进一步充分利用其精准度,新技术门槛相对来说不是特别高。Tumor-uninformed assays的新技术解决方案不够类似于早筛,通过充分利用site-level(碱基素质)扫描精准度并;还有ctDNA突变或片段组学并为基础建模算法进一步充分利用其精准度和抗原,新技术门槛相对来说较高。

2021年4年初29日,《Clinical Cancer Research》在线公开发表了“数使用人人体内ctDNA扫描结肝癌病征相对来说残余病变(MRD)”的评论,首次公开了Guardant Reveal的科学研究图表:MRD扫描精准度达到91%,抗原达100%,这些辨认造出背书了数人人体内ctDNA-MRD扫描(Tumor-uninformed assays)的潜在流行病学领域。

2021年8年初13日,《Clinical Cancer Research》在线公开发表了“顺应潮流:数人人体内ctDNA-MRD扫描的领域现状”的评论,在这那时候科学科学家们研讨审计了数人人体内ctDNA扫描MRD的能力,以及将突变定位到ctDNA扫描的潜在好处。2

Parikh及其老友1 和Taieb及其老友3 研讨了数人人体内ctDNA-MRD扫描在结肝癌(CRC)病征那时候面的潜在流行病学领域。

▲ ctDNA突变和性状在两项科学研究那时候面的领域较为(Parikh和Taieb)

结肝癌(CRC)的用药即使如此面临着一个挑战,即相当多的CRC病征因以同一时间疾病患而提同一时间死亡。尽管流行病学使用了常规的特别设计用药,但高风险IIIC期CRC病征的5年死亡部将也数有53%,究其原因是无法辨认造出CT上未扫描到的相对来说残余病变(MRD)。4

目同一时间,仍迫切必需精准未确定哪些病征术后共存MRD,以帮助聘请减少或上升特别设计用药,并上升救活的不够进一步,同时最大限度地减少过分用药的特别毒素。

在过去的几年那时候,我们对ctDNA在CRC诊断和结节病那时候面的领域有了广为的了解。目同一时间,基于ctDNA的MRD审计正广为领域于同一时间列腺癌的用药那时候面。

ctDNA是由DNA的短片段组成(大约130-150bp),由癌细胞通过不可逆转、坏死或分泌释放到循环系统那时候面。 ctDNA的核素较短所致其成为敏感的可实现负荷标志物,它的共存也许反映了CT上看不见的微转移。

在救活性用药结束后,ctDNA那时候面造出现的细胞分裂性状对随后的CT患不具备较高的那时候面性计算价值,特别是当这些性状与切除的民间组织那时候面的性状一个有时。扫描这种ctDNA假定的MRD可以在I-III期CRC那时候面提同一时间CT数年初计算患,从而为各别再次会患的CRC病征共享一个审计新疗法的售票处。然而,这些ctDNA政治体制性状假定的MRD扫描新方法的精准度即使如此是有限的,迫切必需简简化其扫描精度。

ctDNA的突变扫描优于ctDNA的政治体制性状扫描。ctDNA的突变异不常在CRC那时候面非不常不常见,并被视为大多数癌变的以同一时间过渡期。这种突变,具体假定为DNA那时候面胞嘧啶的C5位置去掉吡啶基团,调节附近遗传的表达,数限于经典电影的抑癌遗传失活。与政治体制性状相比,CRC那时候面共存不够多的突变异不常区域,为充分利用MRD扫描的精准度共享了机会。SEPT9,就是第一个利用血清扫描单遗传突变异不常来进行临床研究和以同一时间扫描CRC的新方法。尽管ctDNA突变有这些优点,但这些相同的特性也必需果断,以保持稳定扫描系统性的抗原,并避免造出现;也那时候面性的不够进一步。

在这种背景下,Parikh和Taieb的都将最新科学研究结果为我们对ctDNA精度的理解共享了有用的缺少,即必需原发民间组织,数通过血清ctDNA突变或共同ctDNA性状即可来进行精准的MRD审计。与其他必需对原发民间组织来进行测序以聘请原先ctDNA系统性的扫描相同,都将科学研究探讨了Tumor-uninformed assays的有效性,它有几个压倒性,数限于短时间的TAT,降低初始成本,对民间组织过剩或不必用的病征来进行数据分析。

Parikh等人共享了一种ctDNA突变为基础ctDNA政治体制性状的相同panel来进行MRD的系统性审计(NGS新方法),与其他商贸上可用的MRD扫描新方法相比,这种新方法不必需切除的民间组织以及自定义简化。在再次用药后使用时,这种数人人体内ctDNA-MRD扫描对患不具备流行病学涵义的抗原(100%)和精准度(55.6%),通过定位一般说来真核生物构造和交叉数据分析系统性,其精准度可进一步充分利用至91%。1 该新方法被运用于正在来进行的批判性科学研究,数限于聘请IIA期复发用药管理者的NRG合作组科学研究(NCT04068103)。虽然还必需额外的图表集来验证这些辨认造出,但这些结果断定了基于ctDNA的MRD扫描在不责怪的情况下可做的扫描精度构造。

Taieb等人的科学研究利用了一对先同一时间被断定是CRC切除后结节病特别的突变遗传标记物WIF1和NPY(ddPCR新方法),并将它们领域于PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试,将III期CRC病征随机分为3个年初 vs 6个年初的特别设计用药。在对参加III期次测试的III期CRC病征来进行的首次ctDNA-MRD审计那时候面,有13.8%的病征术后为ctDNA-MRD那时候面性,并被确认为独立的结节病标志物。3 同时,科学科学家也指造出,与其他使用NGS新方法的ctDNA-MRD科学研究相比,本科学研究那时候面ctDNA的那时候面性部将较低。精准度和PPV同样低于NGS扫描结果,ctDNA-MRD那时候面性和阳性的5年DFS分别为65%和73%,尽管特别设计用药的和不理想的同一时间系统性比对处理就会对这些结果激发影响。该新方法值得注意的是其相对简单,非不常低的成本和潜在的重演性,不必需商贸扫描那时候面所见的专利扫描新方法。正在来进行的批判性科学研究将进一步审计数人人体内ctDNA扫描是否必须精准审计MRD,以便对CRC病征来进行风险分层,并聘请特别设计用药管理者。

无论使用何种新方法,数用人人体内ctDNA-MRD扫描来聘请CRC病征的用药暂时,必需可靠且精准的扫描新方法。需进一步充分利用数人人体内ctDNA-MRD扫描的精准度来未确定哪些病征可以从用药降级那时候面获益,以避免不恰当地选择高危病征做较低强度的用药。Parikh及其老友的科学研究结果表明,定位真核生物和一般说来真核生物以及交叉人人体内数据分析,可显著充分利用数人人体内ctDNA-MRD的精准度。相比之下,ctDNA-MRD扫描的高抗原对于ctDNA作为一个值得注意的人类标志物来未确定用药换装是至关不可忽视的。由于抗原过剩,;也那时候面性的ctDNA-MRD就会使病征做过分的强简化用药。Parikh及其老友的科学研究结果断定,除政治体制性状外,还可以通过为基础一般说来真核生物突变构造的系统性来保持稳定抗原。Taieb等人的系统性新方法的压倒性在于充分利用了流行病学构造的精准度和结节病,但是,正如科学科学家承认的那样,单独的两个遗传突变标记也许无法共享与为基础政治体制性状新方法的精度构造。不可忽视的是,这项工作也重申了常规简化系统性同一时间先决条件条件的不可忽视性,因为各种提取新方法可以在很大程度上影响ctDNA的得部将和值得注意性。在未来的科学研究那时候面,这些系统性同一时间的考虑将变得越来越不可忽视。

突变被归入MRD扫描的蓬勃发展现状是完全一致的,努力这些成效将暂时充分利用下一代MRD扫描的精度。总之,数人人体内ctDNA-MRD的扫描共享了一个独特的机会,使用一种无创新方法来揭示用药方案,并有也许根除高危病征的微转移性病变。这些科学研究结果正因如此为未来ctDNA-MRD聘请的批判性流行病学次测试铺平了高架桥。

MRD,即使如此是一个短时间蓬勃发展的领域,我们届时近两年就会造出现新的迹象,要么推断造出MRD扫描的流行病学好处的局限性,要么推断造出MRD扫描的其他压倒性和新可作。

参考资料:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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